Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAE1Q13564 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NAE1Q13564 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAE1Q13564 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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