Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HDAC1Q13547 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HDAC1Q13547 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
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