Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATMQ13315 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATMQ13315 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATMQ13315 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATMQ13315 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATMQ13315 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATMQ13315 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATMQ13315 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATMQ13315 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATMQ13315 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATMQ13315 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATMQ13315 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATMQ13315 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATMQ13315 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATMQ13315 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATMQ13315 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATMQ13315 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATMQ13315 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATMQ13315 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATMQ13315 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATMQ13315 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATMQ13315 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATMQ13315 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATMQ13315 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATMQ13315 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATMQ13315 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATMQ13315 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATMQ13315 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATMQ13315 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATMQ13315 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATMQ13315 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATMQ13315 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATMQ13315 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATMQ13315 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATMQ13315 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATMQ13315 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATMQ13315 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATMQ13315 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATMQ13315 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATMQ13315 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATMQ13315 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATMQ13315 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATMQ13315 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATMQ13315 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATMQ13315 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATMQ13315 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATMQ13315 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATMQ13315 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATMQ13315 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATMQ13315 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATMQ13315 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATMQ13315 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATMQ13315 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATMQ13315 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATMQ13315 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATMQ13315 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATMQ13315 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATMQ13315 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATMQ13315 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATMQ13315 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATMQ13315 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATMQ13315 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATMQ13315 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATMQ13315 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATMQ13315 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATMQ13315 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATMQ13315 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATMQ13315 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ATMQ13315 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATMQ13315 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATMQ13315 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATMQ13315 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATMQ13315 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATMQ13315 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATMQ13315 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATMQ13315 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATMQ13315 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATMQ13315 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATMQ13315 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATMQ13315 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATMQ13315 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATMQ13315 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATMQ13315 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATMQ13315 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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