Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIK3Q13003 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
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