Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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