Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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