Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms