Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCAPQ12770 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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