Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 PRP19YLL036C 1512 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 TAF8YML114C 1533 nt3.65□□□□□ -1.83
USB1Q12208 DIP2YLR129W 2832 nt3.64□□□□□ -1.83
USB1Q12208 YFT2YDR319C 825 nt3.64□□□□□ -1.83
USB1Q12208 GVP36YIL041W 981 nt3.64□□□□□ -1.83
USB1Q12208 YMR130WYMR130W 909 nt3.64□□□□□ -1.83
USB1Q12208 TPP1YMR156C 717 nt3.64□□□□□ -1.83
USB1Q12208 RER1YCL001W 567 nt3.64□□□□□ -1.83
USB1Q12208 BRE4YDL231C 3378 nt3.64□□□□□ -1.83
USB1Q12208 SWP82YFL049W 1872 nt3.64□□□□□ -1.83
USB1Q12208 CDS1YBR029C 1374 nt3.63□□□□□ -1.83
USB1Q12208 RNA14YMR061W 2034 nt3.63□□□□□ -1.83
USB1Q12208 SVF1YDR346C 1446 nt3.63□□□□□ -1.83
USB1Q12208 IDS2YJL146W 1410 nt3.63□□□□□ -1.83
USB1Q12208 YCR050CYCR050C 309 nt3.63□□□□□ -1.83
USB1Q12208 PXR1YGR280C 816 nt3.63□□□□□ -1.83
USB1Q12208 ECM34YHL043W 513 nt3.63□□□□□ -1.83
USB1Q12208 EFB1YAL003W 621 nt3.63□□□□□ -1.83
USB1Q12208 YJL218WYJL218W 591 nt3.63□□□□□ -1.83
USB1Q12208 YLR374CYLR374C 390 nt3.63□□□□□ -1.83
USB1Q12208 RRP40YOL142W 723 nt3.63□□□□□ -1.83
USB1Q12208 PBN1YCL052C 1251 nt3.63□□□□□ -1.83
USB1Q12208 BUD8YLR353W 1812 nt3.63□□□□□ -1.83
USB1Q12208 ADY3YDL239C 2373 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 FLO8YER109C 2400 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 KIP3YGL216W 2418 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 GCD1YOR260W 1737 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 BCH2YKR027W 2298 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 HOYDL227C 1761 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 HST1YOL068C 1512 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 THI13YDL244W 1023 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 THI11YJR156C 1023 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 RDN5-1RDN5-1 121 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 RDN5-6RDN5-6 121 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 TDA5YLR426W 981 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 SHE1YBL031W 1017 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 SYF1YDR416W 2580 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 PEX30YLR324W 1572 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 FAS2YPL231W 5664 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 RAD1YPL022W 3303 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 SPC105YGL093W 2754 nt3.62□□□□□ -1.83
USB1Q12208 MSN4YKL062W 1893 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 UGA3YDL170W 1587 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 VAC7YNL054W 3498 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 OCA4YCR095C 1089 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 PTC1YDL006W 846 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 AAD6YFL056C 639 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 YGL132WYGL132W 336 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 COX18YGR062C 951 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 MRP4YHL004W 1185 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 YLR156WYLR156W 345 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 YLR159WYLR159W 345 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 YLR161WYLR161W 345 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 AST1YBL069W 1290 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 SUI1YNL244C 327 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 SPT23YKL020C 3249 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 GDH2YDL215C 3279 nt3.61□□□□□ -1.83
USB1Q12208 AZR1YGR224W 1842 nt3.6□□□□□ -1.83
USB1Q12208 SEN1YLR430W 6696 nt3.6□□□□□ -1.83
USB1Q12208 MMT1YMR177W 1533 nt3.6□□□□□ -1.83
USB1Q12208 PMC1YGL006W 3522 nt3.6□□□□□ -1.83
USB1Q12208 YDR444WYDR444W 2064 nt3.6□□□□□ -1.83
USB1Q12208 RPC53YDL150W 1269 nt3.6□□□□□ -1.83
USB1Q12208 YAE1YJR067C 426 nt3.6□□□□□ -1.83
USB1Q12208 TAF11YML015C 1041 nt3.6□□□□□ -1.83
USB1Q12208 VPS69YPR087W 321 nt3.6□□□□□ -1.83
USB1Q12208 RPN6YDL097C 1305 nt3.6□□□□□ -1.83
USB1Q12208 TRM11YOL124C 1302 nt3.6□□□□□ -1.83
USB1Q12208 ATG32YIL146C 1590 nt3.59□□□□□ -1.83
USB1Q12208 FOX2YKR009C 2703 nt3.59□□□□□ -1.83
USB1Q12208 COS6YGR295C 1146 nt3.59□□□□□ -1.83
USB1Q12208 SRP40YKR092C 1221 nt3.59□□□□□ -1.83
USB1Q12208 OCA1YNL099C 717 nt3.59□□□□□ -1.83
USB1Q12208 YOL075CYOL075C 3885 nt3.59□□□□□ -1.83
USB1Q12208 RPN5YDL147W 1338 nt3.59□□□□□ -1.83
USB1Q12208 DXO1YDR370C 1329 nt3.59□□□□□ -1.83
USB1Q12208 FAR10YLR238W 1437 nt3.59□□□□□ -1.84
USB1Q12208 KIC1YHR102W 3243 nt3.59□□□□□ -1.84
USB1Q12208 GGA1YDR358W 1674 nt3.59□□□□□ -1.84
USB1Q12208 YRM1YOR172W 2361 nt3.58□□□□□ -1.84
USB1Q12208 YDL183CYDL183C 963 nt3.58□□□□□ -1.84
USB1Q12208 TAF10YDR167W 621 nt3.58□□□□□ -1.84
USB1Q12208 YER067C-AYER067C-A 324 nt3.58□□□□□ -1.84
USB1Q12208 YFR045WYFR045W 930 nt3.58□□□□□ -1.84
USB1Q12208 ELO3YLR372W 1038 nt3.58□□□□□ -1.84
USB1Q12208 HEK2YBL032W 1146 nt3.58□□□□□ -1.84
USB1Q12208 KRE5YOR336W 4098 nt3.58□□□□□ -1.84
USB1Q12208 PHO12YHR215W 1404 nt3.58□□□□□ -1.84
USB1Q12208 PHO11YAR071W 1404 nt3.58□□□□□ -1.84
USB1Q12208 SOF1YLL011W 1470 nt3.58□□□□□ -1.84
USB1Q12208 MSK1YNL073W 1731 nt3.58□□□□□ -1.84
USB1Q12208 YPK9YOR291W 4419 nt3.57□□□□□ -1.84
USB1Q12208 RPS13YDR064W 456 nt3.57□□□□□ -1.84
USB1Q12208 ENT5YDR153C 1236 nt3.57□□□□□ -1.84
USB1Q12208 STB3YDR169C 1542 nt3.57□□□□□ -1.84
USB1Q12208 PRP31YGR091W 1485 nt3.57□□□□□ -1.84
USB1Q12208 YGR291CYGR291C 222 nt3.57□□□□□ -1.84
USB1Q12208 YLL017WYLL017W 312 nt3.57□□□□□ -1.84
USB1Q12208 PAM18YLR008C 507 nt3.57□□□□□ -1.84
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