Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC15Q0P6D6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC15Q0P6D6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms