Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBBP4Q09028 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms