Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms