Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLEQ07864 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLEQ07864 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLEQ07864 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLEQ07864 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
POLEQ07864 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLEQ07864 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLEQ07864 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLEQ07864 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLEQ07864 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLEQ07864 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLEQ07864 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLEQ07864 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLEQ07864 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLEQ07864 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLEQ07864 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLEQ07864 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLEQ07864 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLEQ07864 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLEQ07864 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLEQ07864 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLEQ07864 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLEQ07864 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLEQ07864 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLEQ07864 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLEQ07864 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLEQ07864 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLEQ07864 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLEQ07864 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLEQ07864 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLEQ07864 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLEQ07864 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLEQ07864 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLEQ07864 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLEQ07864 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLEQ07864 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
POLEQ07864 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
POLEQ07864 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLEQ07864 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLEQ07864 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLEQ07864 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLEQ07864 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLEQ07864 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLEQ07864 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLEQ07864 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLEQ07864 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLEQ07864 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLEQ07864 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLEQ07864 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLEQ07864 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLEQ07864 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLEQ07864 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLEQ07864 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLEQ07864 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLEQ07864 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLEQ07864 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLEQ07864 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
POLEQ07864 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLEQ07864 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLEQ07864 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLEQ07864 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLEQ07864 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLEQ07864 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLEQ07864 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLEQ07864 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
POLEQ07864 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLEQ07864 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms