Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRTAP1-1Q07627 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KRTAP1-1Q07627 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms