Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL18Q07020 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL18Q07020 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms