Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX1T1Q06455 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX1T1Q06455 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms