Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DEUP1Q05D60 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms