Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCZQ05513 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCZQ05513 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCZQ05513 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms