Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR4Q05215 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR4Q05215 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR4Q05215 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR4Q05215 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR4Q05215 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR4Q05215 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR4Q05215 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR4Q05215 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR4Q05215 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR4Q05215 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR4Q05215 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR4Q05215 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR4Q05215 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EGR4Q05215 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms