Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN12Q05209 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PTPN12Q05209 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN12Q05209 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPN12Q05209 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPN12Q05209 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN12Q05209 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN12Q05209 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTPN12Q05209 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN12Q05209 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN12Q05209 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN12Q05209 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN12Q05209 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN12Q05209 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN12Q05209 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN12Q05209 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN12Q05209 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN12Q05209 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN12Q05209 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN12Q05209 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN12Q05209 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTPN12Q05209 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN12Q05209 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN12Q05209 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN12Q05209 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN12Q05209 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN12Q05209 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN12Q05209 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN12Q05209 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN12Q05209 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN12Q05209 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN12Q05209 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN12Q05209 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN12Q05209 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN12Q05209 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN12Q05209 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPN12Q05209 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN12Q05209 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN12Q05209 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN12Q05209 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PTPN12Q05209 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN12Q05209 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN12Q05209 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN12Q05209 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN12Q05209 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN12Q05209 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN12Q05209 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN12Q05209 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN12Q05209 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN12Q05209 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN12Q05209 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN12Q05209 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN12Q05209 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms