Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAP2Q03519 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAP2Q03519 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAP2Q03519 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAP2Q03519 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAP2Q03519 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAP2Q03519 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TAP2Q03519 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TAP2Q03519 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAP2Q03519 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAP2Q03519 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAP2Q03519 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TAP2Q03519 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAP2Q03519 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAP2Q03519 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAP2Q03519 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAP2Q03519 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAP2Q03519 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAP2Q03519 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAP2Q03519 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAP2Q03519 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAP2Q03519 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAP2Q03519 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAP2Q03519 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAP2Q03519 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms