Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NHLH1Q02575 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NHLH1Q02575 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms