Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms