Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B4GALNT1Q00973 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
B4GALNT1Q00973 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms