Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK16Q00536 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms