Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDK6Q00534 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CDK6Q00534 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms