Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2BQ00403 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2BQ00403 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms