Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	RIM4	YHL024W	2142 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	YGL140C	YGL140C	3660 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	FAA4	YMR246W	2085 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	PRP11	YDL043C	801 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	IRC22	YEL001C	678 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	tL(UAG)J	tL(UAG)J	82 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	tL(UAG)L1	tL(UAG)L1	82 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	tL(UAG)L2	tL(UAG)L2	82 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	WSS1	YHR134W	810 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	IRC25	YLR021W	540 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	YPL114W	YPL114W	420 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	YPR108W-A	YPR108W-A	213 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	MSD1	YPL104W	1977 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	ALA1	YOR335C	2877 nt		2.39	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	MDM30	YLR368W	1797 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	UBP7	YIL156W	3216 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	SNQ2	YDR011W	4506 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	FAP7	YDL166C	594 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	YDR464C-A	YDR464C-A	189 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	DCV1	YFR012W	609 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	YKL107W	YKL107W	930 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	RMA1	YKL132C	1293 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	RIM11	YMR139W	1113 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	ASI2	YNL159C	870 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	MVD1	YNR043W	1191 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	LDS2	YOL047C	1071 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	YPL168W	YPL168W	1293 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	MET7	YOR241W	1647 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	YSP2	YDR326C	4317 nt		2.38	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	MTR10	YOR160W	2919 nt		2.37	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	YLR352W	YLR352W	2424 nt		2.37	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	RIF1	YBR275C	5751 nt		2.37	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	TED1	YIL039W	1422 nt		2.37	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	HOS1	YPR068C	1413 nt		2.37	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	PSF1	YDR013W	627 nt		2.37	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	DPB4	YDR121W	591 nt		2.37	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	FCF1	YDR339C	570 nt		2.37	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	YBL010C	YBL010C	843 nt		2.37	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	SHH3	YMR118C	591 nt		2.37	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	MED7	YOL135C	669 nt		2.37	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	YOR008W-B	YOR008W-B	102 nt		2.37	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	TGL4	YKR089C	2733 nt		2.36	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	YFL065C	YFL065C	309 nt		2.36	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	FUR1	YHR128W	651 nt		2.36	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	YHR173C	YHR173C	339 nt		2.36	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	CDC11	YJR076C	1248 nt		2.36	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	URA4	YLR420W	1095 nt		2.36	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	TIR2	YOR010C	756 nt		2.36	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	DCS2	YOR173W	1062 nt		2.36	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	ECM8	YBR076W	1065 nt		2.36	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	SPN1	YPR133C	1233 nt		2.36	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	RTT109	YLL002W	1311 nt		2.36	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	HOM3	YER052C	1584 nt		2.36	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	RRN6	YBL014C	2685 nt		2.35	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	SPT10	YJL127C	1923 nt		2.35	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	MSW1	YDR268W	1140 nt		2.35	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	TMA19	YKL056C	504 nt		2.35	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	COX19	YLL018C-A	297 nt		2.35	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	YLR049C	YLR049C	1287 nt		2.35	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	MOH1	YBL049W	417 nt		2.35	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	RPA135	YPR010C	3612 nt		2.35	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	ALG2	YGL065C	1512 nt		2.35	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	MYO3	YKL129C	3819 nt		2.35	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	MTR4	YJL050W	3222 nt		2.34	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	RNT1	YMR239C	1416 nt		2.34	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	PRP40	YKL012W	1752 nt		2.34	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	BUD4	YJR092W	4344 nt		2.34	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	RPS8B	YER102W	603 nt		2.34	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	SKI6	YGR195W	741 nt		2.34	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	IGO2	YHR132W-A	396 nt		2.34	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	MGM101	YJR144W	810 nt		2.34	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	FLD1	YLR404W	858 nt		2.34	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	RPS8A	YBL072C	603 nt		2.34	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	RRP36	YOR287C	903 nt		2.34	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	RET3	YPL010W	570 nt		2.34	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	SIT1	YEL065W	1887 nt		2.34	□□□□□ -2.03
DDR2	P89113	HMG1	YML075C	3165 nt		2.34	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	KRI1	YNL308C	1776 nt		2.33	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	SSM4	YIL030C	3960 nt		2.33	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	BCD1	YHR040W	1101 nt		2.33	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	YJR037W	YJR037W	384 nt		2.33	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	PAM18	YLR008C	507 nt		2.33	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	YOR338W	YOR338W	1092 nt		2.33	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	DYN1	YKR054C	12279 nt		2.33	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	GAS3	YMR215W	1575 nt		2.32	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	URA7	YBL039C	1740 nt		2.32	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	MAF1	YDR005C	1188 nt		2.32	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	RPA14	YDR156W	414 nt		2.32	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	YDR271C	YDR271C	372 nt		2.32	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	SPT3	YDR392W	1014 nt		2.32	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	UBC8	YEL012W	657 nt		2.32	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	YFR034W-A	YFR034W-A	288 nt		2.32	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	RAD33	YML011C	534 nt		2.32	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	RFA2	YNL312W	822 nt		2.32	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	NAT5	YOR253W	531 nt		2.32	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	SNF8	YPL002C	702 nt		2.32	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	RPS9B	YBR189W	588 nt		2.32	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	SMC3	YJL074C	3693 nt		2.32	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	RSC3	YDR303C	2658 nt		2.32	□□□□□ -2.04
DDR2	P89113	SPO14	YKR031C	5052 nt		2.32	□□□□□ -2.04

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