Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG7P83436 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG7P83436 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG7P83436 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG7P83436 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COG7P83436 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG7P83436 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG7P83436 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG7P83436 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COG7P83436 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG7P83436 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG7P83436 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG7P83436 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COG7P83436 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG7P83436 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG7P83436 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG7P83436 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG7P83436 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG7P83436 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG7P83436 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG7P83436 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG7P83436 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COG7P83436 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG7P83436 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG7P83436 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG7P83436 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG7P83436 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COG7P83436 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG7P83436 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COG7P83436 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG7P83436 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG7P83436 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG7P83436 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG7P83436 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG7P83436 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG7P83436 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG7P83436 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG7P83436 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG7P83436 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COG7P83436 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG7P83436 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG7P83436 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG7P83436 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG7P83436 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG7P83436 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG7P83436 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG7P83436 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG7P83436 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COG7P83436 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG7P83436 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COG7P83436 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG7P83436 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COG7P83436 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COG7P83436 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COG7P83436 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG7P83436 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG7P83436 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG7P83436 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COG7P83436 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG7P83436 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG7P83436 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG7P83436 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COG7P83436 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG7P83436 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG7P83436 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG7P83436 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG7P83436 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG7P83436 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG7P83436 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG7P83436 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COG7P83436 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG7P83436 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG7P83436 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG7P83436 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG7P83436 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG7P83436 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG7P83436 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG7P83436 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COG7P83436 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG7P83436 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG7P83436 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG7P83436 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG7P83436 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COG7P83436 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG7P83436 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG7P83436 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG7P83436 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG7P83436 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COG7P83436 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG7P83436 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG7P83436 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG7P83436 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG7P83436 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG7P83436 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG7P83436 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG7P83436 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG7P83436 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COG7P83436 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG7P83436 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG7P83436 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms