Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRX1P78414 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRX1P78414 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRX1P78414 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRX1P78414 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRX1P78414 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRX1P78414 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRX1P78414 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRX1P78414 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRX1P78414 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRX1P78414 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRX1P78414 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRX1P78414 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRX1P78414 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRX1P78414 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRX1P78414 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRX1P78414 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IRX1P78414 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRX1P78414 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRX1P78414 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IRX1P78414 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRX1P78414 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRX1P78414 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRX1P78414 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRX1P78414 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRX1P78414 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRX1P78414 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRX1P78414 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRX1P78414 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRX1P78414 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRX1P78414 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRX1P78414 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRX1P78414 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRX1P78414 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRX1P78414 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRX1P78414 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRX1P78414 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRX1P78414 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRX1P78414 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX1P78414 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX1P78414 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX1P78414 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX1P78414 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX1P78414 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRX1P78414 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX1P78414 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX1P78414 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX1P78414 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX1P78414 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX1P78414 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX1P78414 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX1P78414 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX1P78414 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX1P78414 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX1P78414 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRX1P78414 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX1P78414 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX1P78414 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX1P78414 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX1P78414 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX1P78414 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX1P78414 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX1P78414 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX1P78414 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX1P78414 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX1P78414 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX1P78414 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX1P78414 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRX1P78414 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX1P78414 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX1P78414 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX1P78414 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX1P78414 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX1P78414 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX1P78414 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX1P78414 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRX1P78414 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX1P78414 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX1P78414 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX1P78414 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX1P78414 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX1P78414 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX1P78414 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX1P78414 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRX1P78414 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms