Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IRX6P78412 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IRX6P78412 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IRX6P78412 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IRX6P78412 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IRX6P78412 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
IRX6P78412 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IRX6P78412 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IRX6P78412 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IRX6P78412 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRX6P78412 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRX6P78412 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRX6P78412 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRX6P78412 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX6P78412 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX6P78412 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX6P78412 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX6P78412 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX6P78412 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX6P78412 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX6P78412 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX6P78412 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX6P78412 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX6P78412 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRX6P78412 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRX6P78412 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRX6P78412 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRX6P78412 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRX6P78412 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRX6P78412 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRX6P78412 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX6P78412 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX6P78412 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX6P78412 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX6P78412 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX6P78412 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX6P78412 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX6P78412 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX6P78412 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRX6P78412 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRX6P78412 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRX6P78412 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRX6P78412 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRX6P78412 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
IRX6P78412 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRX6P78412 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRX6P78412 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRX6P78412 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IRX6P78412 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IRX6P78412 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IRX6P78412 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IRX6P78412 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IRX6P78412 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IRX6P78412 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IRX6P78412 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
IRX6P78412 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX6P78412 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX6P78412 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX6P78412 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX6P78412 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX6P78412 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX6P78412 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX6P78412 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX6P78412 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX6P78412 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX6P78412 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX6P78412 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX6P78412 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX6P78412 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX6P78412 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX6P78412 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX6P78412 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX6P78412 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX6P78412 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX6P78412 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX6P78412 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX6P78412 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX6P78412 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
IRX6P78412 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX6P78412 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX6P78412 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX6P78412 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX6P78412 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX6P78412 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX6P78412 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX6P78412 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX6P78412 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX6P78412 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IRX6P78412 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRX6P78412 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
IRX6P78412 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRX6P78412 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRX6P78412 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IRX6P78412 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX6P78412 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX6P78412 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX6P78412 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX6P78412 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX6P78412 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX6P78412 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms