Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIRPAP78324 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRPAP78324 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms