Protein–RNA interactions for Protein: P63220

RPS21, 40S ribosomal protein S21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS21P63220 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS21P63220 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS21P63220 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS21P63220 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS21P63220 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS21P63220 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS21P63220 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS21P63220 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS21P63220 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS21P63220 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS21P63220 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS21P63220 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS21P63220 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS21P63220 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS21P63220 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS21P63220 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS21P63220 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS21P63220 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS21P63220 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS21P63220 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS21P63220 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS21P63220 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS21P63220 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS21P63220 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS21P63220 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS21P63220 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS21P63220 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS21P63220 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS21P63220 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS21P63220 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS21P63220 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS21P63220 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS21P63220 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS21P63220 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS21P63220 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS21P63220 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS21P63220 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS21P63220 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS21P63220 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS21P63220 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS21P63220 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS21P63220 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS21P63220 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS21P63220 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS21P63220 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS21P63220 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS21P63220 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS21P63220 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS21P63220 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS21P63220 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS21P63220 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS21P63220 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS21P63220 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS21P63220 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS21P63220 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS21P63220 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS21P63220 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS21P63220 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS21P63220 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS21P63220 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS21P63220 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS21P63220 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS21P63220 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS21P63220 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS21P63220 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS21P63220 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS21P63220 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms