Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAMP2P63027 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms