Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL30P62888 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL30P62888 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL30P62888 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL30P62888 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL30P62888 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL30P62888 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL30P62888 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL30P62888 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL30P62888 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL30P62888 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL30P62888 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL30P62888 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL30P62888 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL30P62888 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL30P62888 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL30P62888 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL30P62888 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL30P62888 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL30P62888 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL30P62888 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms