Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00315P59091 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms