Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP4BP1P59074 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHMP4BP1P59074 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP4BP1P59074 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms