Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP11P59045 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP11P59045 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP11P59045 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP11P59045 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP11P59045 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP11P59045 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP11P59045 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP11P59045 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP11P59045 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP11P59045 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NLRP11P59045 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP11P59045 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP11P59045 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms