Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMIN4P57678 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GEMIN4P57678 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms