Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2BFSP57053 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2BFSP57053 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms