Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3BP55884 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3BP55884 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3BP55884 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms