Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC13P55735 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC13P55735 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC13P55735 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC13P55735 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC13P55735 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC13P55735 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC13P55735 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC13P55735 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC13P55735 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC13P55735 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC13P55735 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC13P55735 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC13P55735 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC13P55735 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC13P55735 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC13P55735 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC13P55735 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC13P55735 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC13P55735 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC13P55735 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC13P55735 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC13P55735 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC13P55735 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC13P55735 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC13P55735 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC13P55735 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC13P55735 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC13P55735 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC13P55735 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC13P55735 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC13P55735 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC13P55735 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC13P55735 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC13P55735 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC13P55735 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC13P55735 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC13P55735 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC13P55735 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC13P55735 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC13P55735 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC13P55735 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC13P55735 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC13P55735 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC13P55735 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC13P55735 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC13P55735 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC13P55735 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC13P55735 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC13P55735 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC13P55735 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC13P55735 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC13P55735 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC13P55735 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC13P55735 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC13P55735 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC13P55735 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC13P55735 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC13P55735 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC13P55735 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC13P55735 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC13P55735 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC13P55735 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC13P55735 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC13P55735 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC13P55735 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC13P55735 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC13P55735 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC13P55735 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC13P55735 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC13P55735 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC13P55735 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC13P55735 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC13P55735 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC13P55735 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC13P55735 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC13P55735 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC13P55735 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC13P55735 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC13P55735 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC13P55735 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC13P55735 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms