Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC12A2P55011 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms