Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP12AP54707 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP12AP54707 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATP12AP54707 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATP12AP54707 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ATP12AP54707 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP12AP54707 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP12AP54707 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms