Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms