Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN1P54253 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN1P54253 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms