Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HK3P52790 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HK3P52790 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HK3P52790 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HK3P52790 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HK3P52790 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HK3P52790 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HK3P52790 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HK3P52790 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HK3P52790 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HK3P52790 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HK3P52790 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HK3P52790 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HK3P52790 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HK3P52790 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HK3P52790 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HK3P52790 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HK3P52790 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HK3P52790 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HK3P52790 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HK3P52790 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HK3P52790 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HK3P52790 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HK3P52790 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HK3P52790 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HK3P52790 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HK3P52790 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HK3P52790 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HK3P52790 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HK3P52790 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HK3P52790 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HK3P52790 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HK3P52790 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HK3P52790 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HK3P52790 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HK3P52790 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HK3P52790 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HK3P52790 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HK3P52790 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HK3P52790 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HK3P52790 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HK3P52790 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HK3P52790 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HK3P52790 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HK3P52790 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HK3P52790 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HK3P52790 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HK3P52790 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HK3P52790 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HK3P52790 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HK3P52790 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HK3P52790 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HK3P52790 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HK3P52790 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HK3P52790 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HK3P52790 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HK3P52790 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HK3P52790 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HK3P52790 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HK3P52790 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HK3P52790 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HK3P52790 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HK3P52790 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HK3P52790 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HK3P52790 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HK3P52790 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HK3P52790 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HK3P52790 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HK3P52790 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HK3P52790 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HK3P52790 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HK3P52790 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HK3P52790 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HK3P52790 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HK3P52790 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HK3P52790 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HK3P52790 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HK3P52790 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HK3P52790 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HK3P52790 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HK3P52790 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms