Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF1P51825 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF1P51825 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF1P51825 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF1P51825 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF1P51825 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF1P51825 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF1P51825 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF1P51825 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF1P51825 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFF1P51825 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFF1P51825 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFF1P51825 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AFF1P51825 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFF1P51825 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFF1P51825 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFF1P51825 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFF1P51825 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFF1P51825 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFF1P51825 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFF1P51825 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AFF1P51825 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AFF1P51825 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFF1P51825 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFF1P51825 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AFF1P51825 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AFF1P51825 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AFF1P51825 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFF1P51825 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AFF1P51825 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AFF1P51825 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AFF1P51825 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AFF1P51825 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFF1P51825 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFF1P51825 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFF1P51825 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFF1P51825 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFF1P51825 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFF1P51825 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFF1P51825 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFF1P51825 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFF1P51825 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFF1P51825 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFF1P51825 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFF1P51825 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFF1P51825 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFF1P51825 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AFF1P51825 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFF1P51825 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFF1P51825 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFF1P51825 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFF1P51825 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFF1P51825 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFF1P51825 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AFF1P51825 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFF1P51825 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AFF1P51825 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFF1P51825 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFF1P51825 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFF1P51825 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFF1P51825 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFF1P51825 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFF1P51825 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AFF1P51825 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AFF1P51825 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AFF1P51825 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AFF1P51825 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFF1P51825 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AFF1P51825 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms