Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCNN1BP51168 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms