Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPT1P50897 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPT1P50897 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPT1P50897 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPT1P50897 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPT1P50897 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPT1P50897 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPT1P50897 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPT1P50897 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPT1P50897 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPT1P50897 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPT1P50897 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPT1P50897 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPT1P50897 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPT1P50897 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPT1P50897 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPT1P50897 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPT1P50897 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPT1P50897 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPT1P50897 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPT1P50897 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPT1P50897 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPT1P50897 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPT1P50897 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPT1P50897 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPT1P50897 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPT1P50897 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPT1P50897 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPT1P50897 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPT1P50897 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPT1P50897 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PPT1P50897 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPT1P50897 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPT1P50897 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPT1P50897 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPT1P50897 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPT1P50897 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPT1P50897 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPT1P50897 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPT1P50897 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PPT1P50897 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PPT1P50897 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPT1P50897 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPT1P50897 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPT1P50897 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPT1P50897 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms